Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1bO55017 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna1bO55017 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1bO55017 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1bO55017 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.8 ms