Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnk2O54967 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnk2O54967 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnk2O54967 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms