Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TsksO54887 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TsksO54887 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TsksO54887 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TsksO54887 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TsksO54887 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TsksO54887 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TsksO54887 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TsksO54887 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TsksO54887 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TsksO54887 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TsksO54887 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TsksO54887 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TsksO54887 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TsksO54887 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TsksO54887 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TsksO54887 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TsksO54887 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TsksO54887 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TsksO54887 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TsksO54887 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TsksO54887 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TsksO54887 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TsksO54887 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TsksO54887 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TsksO54887 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TsksO54887 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TsksO54887 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TsksO54887 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TsksO54887 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TsksO54887 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TsksO54887 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TsksO54887 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TsksO54887 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TsksO54887 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TsksO54887 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TsksO54887 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TsksO54887 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TsksO54887 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TsksO54887 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TsksO54887 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TsksO54887 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TsksO54887 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TsksO54887 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TsksO54887 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TsksO54887 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TsksO54887 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TsksO54887 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TsksO54887 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TsksO54887 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TsksO54887 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TsksO54887 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TsksO54887 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TsksO54887 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TsksO54887 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TsksO54887 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TsksO54887 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TsksO54887 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TsksO54887 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TsksO54887 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TsksO54887 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TsksO54887 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TsksO54887 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TsksO54887 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TsksO54887 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TsksO54887 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TsksO54887 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms