Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EdaO54693 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EdaO54693 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EdaO54693 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EdaO54693 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EdaO54693 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EdaO54693 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EdaO54693 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EdaO54693 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EdaO54693 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EdaO54693 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EdaO54693 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EdaO54693 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EdaO54693 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EdaO54693 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EdaO54693 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EdaO54693 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EdaO54693 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EdaO54693 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EdaO54693 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EdaO54693 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EdaO54693 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EdaO54693 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EdaO54693 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EdaO54693 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EdaO54693 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EdaO54693 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EdaO54693 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EdaO54693 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EdaO54693 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EdaO54693 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EdaO54693 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EdaO54693 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EdaO54693 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EdaO54693 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EdaO54693 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EdaO54693 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EdaO54693 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EdaO54693 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EdaO54693 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EdaO54693 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EdaO54693 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EdaO54693 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EdaO54693 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EdaO54693 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EdaO54693 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EdaO54693 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EdaO54693 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EdaO54693 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EdaO54693 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EdaO54693 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EdaO54693 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EdaO54693 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EdaO54693 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EdaO54693 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EdaO54693 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EdaO54693 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EdaO54693 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EdaO54693 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EdaO54693 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EdaO54693 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EdaO54693 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EdaO54693 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EdaO54693 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EdaO54693 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EdaO54693 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EdaO54693 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EdaO54693 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EdaO54693 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EdaO54693 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EdaO54693 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EdaO54693 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EdaO54693 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EdaO54693 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EdaO54693 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EdaO54693 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EdaO54693 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EdaO54693 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EdaO54693 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EdaO54693 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EdaO54693 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EdaO54693 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EdaO54693 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EdaO54693 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EdaO54693 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EdaO54693 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EdaO54693 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EdaO54693 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms