Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek2O35942 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek2O35942 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek2O35942 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek2O35942 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek2O35942 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek2O35942 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek2O35942 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek2O35942 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek2O35942 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek2O35942 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek2O35942 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nek2O35942 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek2O35942 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms