Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg3O35902 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsg3O35902 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dsg3O35902 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms