Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk4O35493 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk4O35493 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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