Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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