Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3cO35066 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3cO35066 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3cO35066 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms