Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PbsnO08976 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PbsnO08976 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PbsnO08976 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PbsnO08976 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PbsnO08976 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PbsnO08976 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PbsnO08976 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PbsnO08976 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PbsnO08976 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PbsnO08976 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PbsnO08976 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PbsnO08976 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PbsnO08976 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PbsnO08976 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PbsnO08976 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PbsnO08976 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PbsnO08976 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PbsnO08976 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PbsnO08976 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms