Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube3aO08759 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3aO08759 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms