Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp2O08574 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mesp2O08574 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mesp2O08574 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms