Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F1

Vmn1r31, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r31L7N2F1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r31L7N2F1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r31L7N2F1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r31L7N2F1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r31L7N2F1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r31L7N2F1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r31L7N2F1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r31L7N2F1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r31L7N2F1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r31L7N2F1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms