Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IfnabL7MTU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IfnabL7MTU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IfnabL7MTU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms