Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3453K7N724 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3453K7N724 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3453K7N724 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3453K7N724 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms