Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2056J3QQ02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2056J3QQ02 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2056J3QQ02 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms