Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gm20877J3QPZ4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20877J3QPZ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm20877J3QPZ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm20877J3QPZ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20877J3QPZ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20877J3QPZ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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