Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17577J3QNF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm17577J3QNF7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17577J3QNF7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm17577J3QNF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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