Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
2610028H24RikG5E8K1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2610028H24RikG5E8K1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2610028H24RikG5E8K1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2610028H24RikG5E8K1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2610028H24RikG5E8K1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610028H24RikG5E8K1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610028H24RikG5E8K1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610028H24RikG5E8K1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610028H24RikG5E8K1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms