Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp17lcG5E8I7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lcG5E8I7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lcG5E8I7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lcG5E8I7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lcG5E8I7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17lcG5E8I7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp17lcG5E8I7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lcG5E8I7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lcG5E8I7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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