Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pnmal2G3X9N3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pnmal2G3X9N3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnmal2G3X9N3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnmal2G3X9N3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pnmal2G3X9N3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms