Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna9G3X8Z7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna9G3X8Z7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna9G3X8Z7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna9G3X8Z7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms