Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmigd3G3X8R9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmigd3G3X8R9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmigd3G3X8R9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmigd3G3X8R9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmigd3G3X8R9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms