Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r39G3UWE6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r39G3UWE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms