Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp9yF8VPU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp9yF8VPU6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp9yF8VPU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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