Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfp946F6VWU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp946F6VWU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp946F6VWU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp946F6VWU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp946F6VWU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms