Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Raph1F2Z3U3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Raph1F2Z3U3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms