Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa35E9QLQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa35E9QLQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms