Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc146E9Q9F7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc146E9Q9F7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc146E9Q9F7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms