Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DspE9Q557 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DspE9Q557 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DspE9Q557 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DspE9Q557 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DspE9Q557 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DspE9Q557 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DspE9Q557 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DspE9Q557 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DspE9Q557 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DspE9Q557 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DspE9Q557 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DspE9Q557 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms