Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krtap11-1E9Q2E9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krtap11-1E9Q2E9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms