Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms