Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lrp3E9Q1T6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrp3E9Q1T6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrp3E9Q1T6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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