Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Trappc8E9PWG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Trappc8E9PWG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trappc8E9PWG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Trappc8E9PWG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trappc8E9PWG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Trappc8E9PWG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trappc8E9PWG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trappc8E9PWG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms