Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt2E9PUL5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt2E9PUL5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt2E9PUL5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms