Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn24D3YXJ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn24D3YXJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn24D3YXJ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms