Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm4297D3YWB7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4297D3YWB7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm4297D3YWB7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm4297D3YWB7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm4297D3YWB7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms