Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nxpe3B9EKK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxpe3B9EKK6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxpe3B9EKK6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nxpe3B9EKK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms