Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tmf1B9EKI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tmf1B9EKI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tmf1B9EKI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tmf1B9EKI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tmf1B9EKI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmf1B9EKI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
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