Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syce3B5KM66 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syce3B5KM66 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Syce3B5KM66 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce3B5KM66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.8 ms