Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cfap58B2RW38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap58B2RW38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap58B2RW38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap58B2RW38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfap58B2RW38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cfap58B2RW38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cfap58B2RW38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfap58B2RW38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms