Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usf3B2RUQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usf3B2RUQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms