Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc22a28B2RT89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc22a28B2RT89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc22a28B2RT89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms