Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prr29B1ARI9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prr29B1ARI9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prr29B1ARI9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prr29B1ARI9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prr29B1ARI9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms