Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc38A3KMP2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc38A3KMP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc38A3KMP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc38A3KMP2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc38A3KMP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc38A3KMP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc38A3KMP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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