Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm5640A3KG49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5640A3KG49 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms