Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fibcd1A2AV25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fibcd1A2AV25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fibcd1A2AV25 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fibcd1A2AV25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms