Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl41A2AUC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl41A2AUC9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms