Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Upf2A2AT37 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Upf2A2AT37 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Upf2A2AT37 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Upf2A2AT37 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms