Protein–RNA interactions for Protein: A2ARK0

Fam83c, Protein FAM83C, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83cA2ARK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83cA2ARK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83cA2ARK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83cA2ARK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83cA2ARK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83cA2ARK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83cA2ARK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83cA2ARK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam83cA2ARK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83cA2ARK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83cA2ARK0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83cA2ARK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83cA2ARK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83cA2ARK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83cA2ARK0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam83cA2ARK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms