Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel3A2AHA7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pramel3A2AHA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramel3A2AHA7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramel3A2AHA7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramel3A2AHA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms